轻度尿道下裂（阴茎头型）通常不影响生育，因睾丸生精功能和激素水平正常。中重度尿道下裂（阴茎体型、阴囊型）可能合并阴茎下弯或尿道开口异常，导致性交困难或精液无法射入阴道，需手术矫正后评估生育能力。

若合并隐睾或内分泌异常（如雄激素不足），可能影响睾丸发育和精子生成，需激素替代治疗。术后阴茎功能恢复良好的患者自然生育率可达80%以上。若存在严重精子异常，可通过试管婴儿技术实现生育。